肠道菌群是指定植在体肠道内并长期与相互依存的细菌群，包括40多个菌属，400到500种菌种，数量达100万亿之多，是细胞的10倍，重量上相当于一个人的肝脏，占健康成人每日排出粪便的1/3到2/5。
肠道菌群是寄生在肠道内的微生物总称，而肠道菌群内对体有益的有双歧杆菌、乳酸杆菌等，能够促进肠道的正常蠕动，还可以帮助肠道吸收营养，维持肠道的正常功能。
肠道内也可能会出现有害菌，比如大肠杆菌、链球菌等，虽然流动性比较大，但是如果在肠道内大量繁殖，可能会引起肠道菌群紊乱，使有益菌受到抑制以后出现肠道功能异常，引起腹胀、腹泻、便秘、腹痛等症状。